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2021年6月28日，客服中心反饋國(guó)內(nèi)某科學(xué)研究院有堆肥樣品檢測(cè)的需求，接到反饋后，材料檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室工程師第一時(shí)間與客戶進(jìn)行詳細(xì)溝通，情況如下：

客戶背景

客戶是國(guó)內(nèi)某科學(xué)研究院的學(xué)生，做了一個(gè)關(guān)于堆肥樣品的研究課題，需要檢測(cè)堆肥樣品的一些元素，便于課題開(kāi)展。

樣品名稱

堆肥樣品

測(cè)試項(xiàng)目

氮、磷、鉀、總碳、腐殖酸。

客戶需求

需要檢測(cè)土壤里面氮、磷、鉀、總碳、腐殖酸，得出數(shù)據(jù)用于課題研究。

解決方案

分析流程：

首先對(duì)高通量測(cè)序下機(jī)的雙端序列原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量篩查，獲取可用于下游宏基因組學(xué)分析的高質(zhì)量數(shù)據(jù)集（Clean  data）    。 隨后對(duì)每個(gè)樣本的高質(zhì)量序列分別進(jìn)行宏基因組序列拼接組裝，構(gòu)建宏基因組 Contigs 和 Scaffolds 序列集，并進(jìn)行基因預(yù)測(cè)，獲得非冗余蛋白序列集。隨后，對(duì)蛋白序列用多種常用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行功能注釋，獲得各等級(jí)的功能類群豐度譜，并進(jìn)行差異比較分析、代謝通路富集分析、聚類分析等。同時(shí)，我們也對(duì)基因序列進(jìn)行物種注釋，獲得種以及種以下精細(xì)水平的物種組成譜，并進(jìn)行差異比較分析、聚類分析、物種組成豐富度和均勻度分析和關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)分析等。基于上述獲得的功能豐度譜和物種組成譜，可以進(jìn)一步對(duì)宏基因組樣本進(jìn)行 Alpha 和Beta 多樣性分析，進(jìn)而依靠多種多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)方法篩選得到宏基因組中的關(guān)鍵生物標(biāo)記物（如關(guān)鍵功能/物種類群）   。  同時(shí)，通過(guò)多種多種數(shù)據(jù)可視化和交互式工具，繪制具備論文發(fā)表水準(zhǔn)的二維/三維圖表，全方位、客觀地呈現(xiàn)以上分析結(jié)果。此外，我們還將根據(jù)樣本來(lái)源，選擇特定的功能數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行注釋分析。

檢測(cè)結(jié)果：

客戶反饋

通過(guò)我們的檢測(cè)，客戶的課題研究有了原始數(shù)據(jù)的支撐，并且對(duì)我們的數(shù)據(jù)非常滿意，后面又陸續(xù)送了幾十批樣品。